金牌瑪莉和超級瑪莉最大的不同之處, 就是分別賦予了瑪莉和路易新的性格. 瑪莉仍和過去一樣, 容易操控和移動, 而路易的跳躍力比瑪莉高得多. 在路易奔跑時如果按下相反方向的鈕, 煞車比較不容易, 而且會向前滑行. 在金牌瑪莉中, 有些特殊磚塊比需要靠路易的特殊跳躍力才能拿到, 此外有些關卡的坑洞距離較寬, 也必須要使用路易才會比較順利跳過. 但是瑪莉的絕佳操控性在狹窄的立足點確非常有用, 因此要選擇瑪莉或是路易進行遊戲, 讓二代增添了更多樂趣. 金牌瑪莉和前一代相同, 仍然是在香菇國中冒險, 打倒魔王庫巴救出公主. 但是在金牌瑪莉中, 遊戲背景要比一代漂亮的多. 無論是磚塊, 筆頭菜或是天空的雲, 都變的更可愛漂亮. 另外金牌瑪莉的關卡數也比一代多, 難度也大幅提升. 由於此款金牌瑪莉早期只有磁碟機版本(有些地方可以買到台版卡帶), 國內很多玩家無緣玩到, 但它仍延續前一代的優點, 是款不得不玩的經典遊戲.